Tras lo sucedido en los Acuerdos de Sokovia, y con Hydra eliminada, S.H.I.E.L.D. ha sido legitimizada otra vez y no necesita volver a operar entre las sombras. Desde que el mundo cree que Coulson está muerto, la organización necesitaba un nuevo director para ser su rostro. Coulson se encuentra a si mismo de nuevo en el papel de agente y haciendo equipo junto con Mack, y ambos son asignados para seguir y confirmar la presencia de la gente con poderes, los llamados Inhumanos. Han estado intentando encontrar a Daisy/Quake, quien ha desaparecido tras un intento de pagar por sus pecados del pasado. Pero con el mundo creyendo que Daisy es peligrosa que ha derrumbado bancos y puentes, el nuevo Director no tiene reparos en acabar con ella del todo. La Agente May tiene la tarea de entrenar a un nuevo equipo de especialistas, y Fitz y Simmons han tomado un gran paso en su relación. Pero el nuevo
